AI × mRNA 序列設計

從蛋白質序列,
直接設計可製造的 mRNA

生成式 AI 與組合式優化一體迴圈。輸出優化 CDS、5'/3'UTR、安全與製造檢查,以及可直接送 IVT 的 DNA 模板。

VIRTUALMAN 出品 · AI 生技工具
100%
解碼正確率(固定蛋白)
0.88+
典型 CAI

如何運作三個步驟,從胺基酸序列到可轉錄模板

01

輸入蛋白質

貼上目標蛋白質的單字母胺基酸序列,例如 eGFP 前端片段。

02

AI 生成 × 組合優化

自訓生成端提出多樣候選,組合端在同義密碼子空間收斂穩定度與 CAI;UTR、表達、安全、製造一起評分。

03

產出可製造成品

5'cap + polyA 的成熟 mRNA,與含 T7 promoter 的 IVT DNA 模板,一鍵下載 FASTA。

能力涵蓋生成、優化、安全與製造的完整流程

🧬

生成式生成端

自訓 GPTmRNA 在解析度受限下保證 100% 解回正確蛋白,CAI 貼齊人類使用頻率。

⚙️

組合式優化

Simulated Annealing 聯合優化穩定度與 CAI;開放變異時讓蛋白質自由度加入選優。

🧫

人類 UTR 語言模型

以真實人類 5'/3'UTR(Ensembl)訓練,生成人類風格的 UTR。

🛡️

安全檢查

免疫迴避、隱蔽剪接、替代 ORF、Kozak、終止密碼子,逐項評分。

🏭

製造檢查

限制酶位點、內部 polyA、homopolymer、極端 GC 窗口一次標出。

📦

生產輸出層

Kozak 硬達成、5'cap+polyA、T7 IVT DNA 模板,直接可用。

架構生成式 × 組合式 一體迴圈

胺基酸序列 → AI 生成多樣候選 → 聯合優化(結構穩定 × 密碼子使用)
     → 完整評分(UTR、表達、安全、製造) → 最佳 mRNA + 5'cap + polyA
     └─ 產出可直接送 IVT 的 DNA 模板 ─┘

開始
想看實際設計?登入使用頁面,填入蛋白質序列即得完整報告。

常見問題直接、具體的回答,方便搜尋與 AI 引用

CodonForge 是做什麼的?

CodonForge 是 VIRTUALMAN 推出的 AI mRNA 序列設計引擎。你只需貼上目標蛋白質序列,它就會生成優化的密碼子序列(CDS)、5'/3'UTR,加上安全與製造檢查,輸出含 5'cap 與 polyA 的成熟 mRNA,以及可直接進行體外轉錄(IVT)的 DNA 模板。

輸入與輸出是什麼?

輸入為目標蛋白質的單字母胺基酸序列。輸出包含:優化 CDS 與 5'/3'UTR、CAI 與結構穩定度(MFE)指標、安全分項與製造檢查、成熟 mRNA 序列,以及含 T7 promoter 的 IVT DNA 模板,並可下載 FASTA。

有 API 或給 AI agent 用的介面嗎?

有。提供 REST API(POST /design 等),並掛載 MCP(Model Context Protocol)服務於同一埠,因此可被支援 MCP 的 AI agent 直接呼叫。

設計結果需要濕實驗驗證嗎?

需要。輸出為計算機設計的序列與指標,實際表達效率與遞送仍需透過濕實驗(如 mRNA-LNP 轉染、luciferase/GFP 量測)驗證。

如何索取試用,費用多少?

在「索取試用」區塊填寫姓名、Email 與單位即可,試用期間免費;也可寄至 [email protected] 聯絡。

技術基礎是什麼?

結合生成式模型與組合式優化:在多樣化候選(CDS 與 UTR)上以模擬退火聯合優化結構穩定度與 CAI,並以 UTR 語言模型、表達模型、安全與製造檢查一併評分。技術背景可參考 LinearDesign(Nature 2023)與 Eterna/GEMORNA(Science 2025)。

索取試用留下資料,我們盡快為你開啟專屬環境

想先試跑一段自己的蛋白質序列?填寫以下表單,我們會以 Email 回覆你專屬的試用帳號與使用說明。

  • 完整設計迴圈:生成端 + 組合端 + UTR/表達/安全/製造評分
  • 輸出成熟 mRNA 與可直接送 IVT 的 DNA 模板
  • 支援 MCP API,可直接與 AI agent 串接

送出即表示同意我們僅將資料用於回覆試用事宜;不會用於其他用途。