Finn Mathiassen var en dansk musikforsker. Mathiassen aflagde organisteksamen i 1950 og blev mag.art. i musikvidenskab fra Aarhus Universitet i 1956. Han har undervist på Det Jyske Musikkonservatorium og var 1959-1996 ansat ved Aarhus Universitet, fra 1966 som professor; samme år blev han dr.phil. på afhandlingen The Style of the Early Motet. Han skrev især om videnskabsteori og emner inden for dansk musik, bl.a. gammel folketonalitet og Carl Nielsen.