We recently tested this notebook. The predicted and experimental structures are well consistent! We highly recommend this, as well as the one for RFdiffusion, as excellent options for everybody to start de novo protein design!
Colab版のRFdiffusionで設計したde novo designタンパク質の結晶構造解析を試してみたところ、予測とよく一致していました。
発現精製から構造解析まで学べるので、来年の学生実習ではde novo タンパク質設計から構造解析までをテーマにしようと考えています。すごい時代。。
colab.research.google.com/github/sokrypt…
